Высокая температура и влажность являются благоприятными условиями для размножения болезнетворных микроорганизмов. По этой причине ежегодно необходимо проводить дезинфекцию конструкции теплицы, причем обработке подлежит и каркас, и материал, которым покрыта теплица. Если в качестве материала используется поликарбонат, необходимо знать, как обработать теплицу и не повредить покрытие теплицы. Поликарбонат долговечен, позволяет создать идеальный микроклимат для растений, однако он весьма чувствителен к внешним воздействиям.
Для обработки покрытия теплицы из поликарбоната может применяться мыльный раствор, смываемый теплой водой, раствор хлорной извести в пропорции 400 г на 10 л воды или иные средства, не содержащие абразивные частицы, так как этот материал легко царапается, и срок службы поликарбоната при обработке абразивом может существенно сократиться. То же касается и применяемых губок, щеток. Их поверхность должна быть мягкой. Недопустимо применение химически агрессивных веществ даже таких безобидных, как стиральный порошок. Обрабатывать теплицы необходимо как снаружи, так и изнутри.
Другой способ дезинфекции — использование дымовой серной шашки. Серная шашка борется с гнилью, плесенью, грибком. Для обработки помещения объемом 20 кубических метров потребуется шашка массой 300 г. Главное условие применения — соблюдение мер безопасности, ведь диоксид серы, выделяемый тлеющей серной шашкой, ядовит. Именно благодаря этому и достигается дезинфицирующий эффект. Однако диоксид серы вреден и для человека, а в высоких концентрациях может вызвать серьезное повреждение здоровья или даже смерть.